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본 발명은 실시간 관측정보에 기초한 침수 수리해석 모델의 동적 개입 제어 방법, 시스템 및 이를 수행하기 위한 기록매체에 관한 것이다. 구체적으로 CCTV 영상, 수위·강우 센서, 기상 레이더, GIS/지형 DB로부터 수집되는 다중 실측 데이터를 기반으로 침수 상황을 실시간 인식하고, 관측데이터와 수리해석 모델의 상태변수를 비교하여 개입 이벤트 발생 여부를 판단한다. 개입 이벤트가 발생하면 실행 중인 침수 수리해석 모델을 일시 정지(pause)시키고, 경계조건 변경, 해석격자의 적어도 일부 셀의 바닥 표고 수정, 관측 기반 상태 보정(Data Assimilation) 중 적어도 하나를 수행한 후 전체 재초기화 없이 재개(resume)시킨다. 이를 통해 침수 해석 결과를 실시간으로 보정하고, 차수판 설치 위치·수량·순서, 펌프 및 수문 제어 명령, 피해 우선순위 리포트 등 침수 대응 정보를 생성하여 현장 대응과 자동 액추에이터 제어를 지원할 수 있다. 본 발명은 도시침수, 지하공간 침수, 배수시설 운영 등 다양한 재난 대응 분야에 적용 가능하며, 실시간성, 예측정확도, 대응효율성을 동시에 향상시키는 효과가 있다.